甘孜藏族自治州人民医院的前身是美籍传教士安德烈夫妇1922年创建的“安息会医院”和国民党西康省筹备委员会1938年创建的“西康省立康定医院”。1950年3月解放，5月军管会分别接管了上述两医院并改组更名为“西康省康定中心卫生院”；1952年5月奉西康省卫生和财政厅联合通知更名为“西康省藏族自治区人民医院”；1955年撤销西康省成立甘孜藏族自治州，正式更名为“甘孜藏族自治州人民医院”至今。是州卫生局直属的全民所有制非营利性综合医院。
甘孜藏族自治州人民医院占地面积2.5万平方米，建筑面积4.0万平方米，编制床位265张，职工总数348人，其中聘用职工291人，招聘职工57人。全院职工中，大专以上学历195人，占卫技人员总数的78.0％。高级专业技术人员43人、中级专业技术人员135人，分别占卫技人员总数的17.2％和54.0％。有享受省政府特殊津贴专家1人，省有突出贡献的专家1人，州级拔尖人才2人，州级学科带头人1人，州行业内学科带头人25人。医院设临床科室16个（其中四川省甲级重点专科1个）、医技科室9个、职能科室9个。配备有螺旋CT机、数字X光机、C臂系统、全自动生化分析仪器、彩色多普勒超声诊断仪、电子胃镜、白内障超乳仪、腹腔镜、鼻内窥镜等大型医疗设备148台（套）。截止至2007年底，大型医疗设备总金额达到了4025万元，门诊人次、住院人次和手术人次分别达到了107543人次、8823人次和3798人次。
甘孜藏族自治州人民医院于1997年6月经四川省医院评审委员会评定为甘孜州单一一所二级甲等医院，2002年9月评审为甘孜州综合性医院中的第一所国际爱婴医院。医院眼科2007年评定为四川省甲级重点专科。